蛋白质如果相似,那么什么相似?空间结构吗?

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/03/29 14:12:32
蛋白质如果相似,那么什么相似?空间结构吗?

蛋白质如果相似,那么什么相似?空间结构吗?
蛋白质如果相似,那么什么相似?空间结构吗?

蛋白质如果相似,那么什么相似?空间结构吗?
首先,蛋白质相似是个很泛泛的概念.
如果是两个蛋白质similarity和identity如何如何,一般可以从以下几个方面考虑.
最根本的是,氨基酸序列相似,看氨基酸的保守性.一般序列比对程序都可以对序列比对进行打分,也就是给你identity的分值,分值越高,一级序列的相似性越好.
二,就是比对结构,PDB数据库收录了很多结构,一级序列相似不一定三级结构就一定相似,但是大多数来讲,如果一级的identity比较高,一般结构都有相似.
三,你可以通过进化上的关系来分析,同家族的蛋白质一般都有一些共性,比如一些带电性、相似的domains,或者一些活性位点.
目前就想到这些,希望对你有所帮助.

有很多可能性吧,具体要放在你要解答的问题里才可以知道的,应该从结构、功能上考虑吧。

不是吧,应该是氨基酸的相似

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